Это самая частая и справедливая претензия к такому переезду: если учёт всё равно в 1С, зачем выносить CRM наружу. Ответ в разделении ролей между учётом и работой с клиентом.
1С сильна там, где нужна точность документа: номенклатура, цены, взаиморасчёты, отгрузки, бухгалтерия. Она плохо приспособлена к тому, что делает отдел продаж каждый день: принимать звонки и сообщения из мессенджеров, вести переписку, строить воронку, ставить задачи, работать с мобильного и видеть аналитику продаж без выгрузки в Excel. Попытки закрыть эти задачи внутри 1С:CRM обычно упираются в интерфейс и производительность при работе десятков менеджеров одновременно.
Правильная целевая схема — не замена 1С, а разделение: сделки, коммуникация, задачи и аналитика в Битрикс24; номенклатура, документы, деньги и учёт в 1С; между ними двусторонний обмен. Контрагент заводится один раз и синхронизируется, счёт формируется в 1С по данным сделки, оплата возвращается в карточку.